前身是私立金陵大學農(nóng)學院和國立中央大學農(nóng)學院。1952年與浙江大學農(nóng)學院部分系科合并為南京農(nóng)學院。1972與當時蘇北農(nóng)學院合并成立江蘇農(nóng)學院，1979恢復為南京農(nóng)學院。1984年改名為南京農(nóng)業(yè)大學。